В 2012 году Никитенко С.Н., ушедшего на пенсию, сменил Алексей Пронькин, назначенный председателем Контрольно-счетной палаты Законодательной Думой Томской области. В должности председателя Контрольно-счетной палаты Пронькин А.Д. проработал до октября 2022 года.
С июня 2023 года на государственную должность председателя Контрольно-счетной палаты Законодательной Думой Томской области была назначена Ирина Жалонкина.
С момента основания КСП заместителем председателя является Василевская Екатерина Даниловна.
Первое аудиторское направление осуществляет контроль за учетом, приватизацией и управлением государственной собственностью;
Второе аудиторское направление осуществляет контроль за расходованием средств областного бюджета на социальную сферу и управление;
Третье аудиторское направление осуществляет контроль за расходованием средств областного бюджета на национальную экономику, правоохранительную деятельность и финансовую помощь местным бюджетам;
Четвертое аудиторское направление осуществляет контроль за расходованием средств областного бюджета на капитальный и текущий ремонт, строительство и реконструкцию объектов;
Пятое аудиторское направление осуществляет контроль за доходами областного бюджета и дотационной поддержкой муниципальных образований Томской области, оценка реализации целей социально-экономического развития Томской области.
Деятельность Контрольно-счетной палаты направлена на реализацию полномочий по осуществлению внешнего государственного финансового контроля в части эффективности использования средств областного бюджета, правомерности и эффективности использования областного государственного имущества, подготовки предложений по совершенствованию бюджетного процесса и управлению областной собственностью, а также на выявление резервов дополнительных источников доходов консолидированного бюджета региона.
Своей деятельностью Контрольно-счетная палата Томской области продолжает выполнение миссии Счетной палаты Российской Федерации по содействию законности и эффективности управления государственными ресурсами, как необходимому условию устойчивого развития нашей области и российского общества.
Для планирования и организации деятельности Палаты, выработки методологии контрольной и экспертно-аналитической работы, рассмотрения и утверждения материалов контрольных мероприятий и решения других важнейших вопросов в Контрольно-счетной палате образована Коллегия, в состав которой входят председатель, заместитель председателя и аудиторы.
КСП уделяет большое внимание укреплению взаимодействия с органами власти, с правоохранительными органами, со Счетной палатой Российской Федерации, контрольно-счетными органами муниципальных образований. Благодаря чему сегодня сформирована единая система финансового контроля в Томской области. Тесное взаимодействие контролирующих органов позволяет решать комплексные задачи эффективного управления государственными финансами.
Одним из основополагающих принципов деятельности Контрольно-счетной палаты является принцип гласности. Отчеты о результатах проведенных контрольных и экспертно-аналитических мероприятиях, годовые отчеты о деятельности Контрольно-счетной палаты предоставляются Законодательной Думе и Губернатору Томской области.
Коллектив Контрольно-счетной палаты Томской области продолжает успешно решать задачи, стоящие перед системой органов государственного финансового контроля, о чем свидетельствуют награды Губернатора Томской области, Законодательной Думы и областной администрации, которых удостоены сотрудники палаты. Сегодня Контрольно-счетная палата Томской области сохраняет динамику развития, стремится идти в ногу со временем и играет заметную роль в бюджетном процессе региона.